分公司负责人应当和总公司签劳动合同的。一般来说总公司对分公司管控直接的是作为委派的分公司管理人员，其工资支付由总公司承担的话，那一般合同是直接和总公司签署，保险和公积金等也同样是由总公司统一支付的，这种管控模式一般是应用于总公司直接控股的分公司或直接分设的分支机构。间接管控的形式是人员由总公司委派参与分公司的运作，但其薪酬支付由分公司承担，但有区别的是有些公司是劳动合同还是由总公司签署，一般是总公司为了确保其对该人员的管控，但也有分公司直接承担保险、公积金等并签署劳动合同的。这种间接管控的形式一般多见于参股分公司当中。