存疑不起诉后再次起诉是合法的，存疑不起诉后需要重新起诉的必须要确定掌握了他人犯罪的证据。
存疑不起诉，又称证据不足的不起诉。存疑不起诉是指检察机关对于经过补充侦查的案件，仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，可以作出不起诉决定。
【法律依据】
《刑事诉讼法》第一百七十一条第四款，对于二次补充侦查的案件，人民检察院仍然认为证据不足，不符合起诉条件的，应当作出不起诉的决定。