1、两者名称不同。不动产证的书面全称为中华人民共和国不动产权证书，而房产证全称为中华人民共和国房地产权证书，同时不动产证是房产证和土地使用权证书的结合。

2、发放证件的机关不同。不动产证登记的机关是县级以上人民政府依法确定的，而房产证发证机关是市县房地产管理局或市县人民政府决定的。

3、费用有所不同。不动产证的测绘通常指测绘一次就可以了，制证的成本费是也是收一次，而房产证在办理这些证书时，需要进行两次测绘，需要缴纳两次测绘费用。