特殊工时制是相对标准工时制而言的，指因工作性质或者生产特点的限制，不能实行标准工时制度的，按照法律规定，可以实行其他工作和休息办法的工时制度。特殊工时制度是否可以由劳动者和用人单位约定呢?其效力又如何呢?下面就和一起来看看吧。

第一，根据《劳动合同法》第十七条规定，劳动者与用人单位之间的劳动合同应当具备以下条款：(一)用人单位的名称、住所和法定代表人或者主要负责人;(二)劳动者的姓名、住址和居民身份证或者其他有效身份证件号码;(三)劳动合同期限;(四)工作内容和工作地点;(五)工作时间和休息休假;(六)劳动报酬;(七)社会保险;(八)劳动保护、劳动条件和职业危害防护;(九)法律、法规规定应当纳入劳动合同的其他事项。劳动合同除前款规定的必备条款外，用人单位与劳动者可以约定试用期、培训、保守秘密、补充保险和福利待遇等其他事项。而劳动时间怎样安排，就涉及单位实施的是何种工时制度。

第二，实施不定时或综合计算等特殊工时，需要经过劳动部门行政审批。然而在实践中，不少用人单位未申请过综合计算工时或不定时工时，就擅自实施起来，理由是合同当中有约定。有的虽有批复但已经过期。还有些用人单位虽在与劳动者签订的劳动合同中约定实行标准工时，但在签订劳动合同后获得了劳动行政部门的许可，同意其在相关岗位实行不定时工时或综合计算工时制，而用人单位与劳动者并未对劳动合同中约定的工时制度进行变更。这些做法确实引发了一些矛盾，那特殊工时制的约定与劳动行政部门批复之间的关系如何，在执行时以约定为准还是以批复为准呢?

第三，若要对劳动者所在岗位施行特殊工时制，需要同时满足两大要件：第一，得到劳动行政部门的批复;第二，劳资双方约定明确。也就是说，如果仅有劳资双方在劳动合同中约定实行特殊工时制，但未获得劳动行政部门的行政审批，是不能对劳动者实行不定时工时制的。如果劳动者所在岗位得到劳动行政部门关于不定时工时制的批准。如果单位确有审批手续，但在劳动合同中约定实行标准工时，我认为还是应按标准工时执行。

所以，单位的特殊工时制度有无经过劳动行政审批、是否尚处于审批的期限内，若是，则有效;反之，则约定无效，仍应按标准工时制执行作息安排。