1、杭白芷的根圆锥形，长10-20cm，直径2-2.5cm。止部近方形或类方形，表面灰棕色，有多数皮孔样横向突起，长0.5-1cm，略排成四纵行，顶端有凹陷的茎痕。质是对实较重，断面白色，粉性，皮部密布棕色油点，形成层环棕色，近方形。气芳香，味辛、微苦。

2、祁白芷的根圆锥形，长7-24cm，直径1.5-2cm。表面灰黄色或黄棕色，较光滑，皮也样横向突起散生，并有支根痕。质硬，断面类白色，粉性，皮部散有棕色油点，形成层环圆形，棕色。以独支、条粗壮、质硬、体重、粉性足、香气浓者为佳。

3、川白芷：较浙白芷粗，但四棱不及断白芷明显，表面黄白色或浅棕黄色.皱纹较明显，断面方形亦不及浙白芷明显，常呈类圆环。“疙瘩丁”较粗大。气香浓郁。过去川白芷以四川遂宁所产为最佳，铜梁所产次之，其他产地叉次。

4、禹白芷(会白芷)：形似胡萝卜，类圆形而细长，直径细于前二种.表面较光滑，横向皮孔(疙瘩丁)少且不及前二种明显，体轻，粉性不足，香气较弱。

5、在显微镜下观察白芷的横切面。杭白芷木栓层为10余列木栓细胞。皮层中有油管分布。韧皮部宽广，筛管群略呈径向排列;油管较多。形成层略呈方形。木质部占根的1/2，导管稀疏散列。本品薄壁细胸含淀粉粒，有的含草酸钙簇晶。祁白芷形成层呈圆环状;木质部占根的1/3，导管呈放射状排列。