由于直接由公检法审批的司法鉴定机构的公正性时常会受到当事人的质疑，所以才会有第三方司法鉴定机构的出现。所谓第三方，是相对于当事人和公检法部门而言。现在第三方司法机构很多，业务也很广泛，包括法医临床、法医物证（DNA）、法医病理、痕迹检验（含道路交通事故痕迹鉴定）、文书检验、司法会计、声响检验、法医毒物（酒精检测、常见毒物、常见毒品）等项目。