其区别主要在于：
第一，登记注册的法律依据不同。商标是依照商标法的规定进行注册，而企业名称则依照公司法、外商投资企业法、中外合资企业法等法律、行政法规进行登记。
第二，取得方式不同。在我国，一般商品的商标采取自愿注册原则，即注册的商标享有专用权，未注册的仍可使用，但不享有专用权;而对企业名称，未经核准登记的名称不准使用，也就不享有名称权。
第三，权利特征和内容不同。商标权可以自身使用，也可以许可给他人使用，但企业名称权一般不允许单独转让或者许可他人使用。
需要注意的是，某些企业将他人的中文商标作为企业名称的一部分进行登记，对此我国法律目前没有明确禁止，但如果将与他人注册商标相同或者相近似的文字作为企业的字号在相同或者类似商品上突出使用，容易使相关公众产生误认的，仍然构成侵权商标权。
《商标法》第九条
申请注册的商标，应当有显著特征，便于识别，并不得与他人在先取得的合法权利相冲突。 商标注册人有权标明“注册商标”或者注册标记。