不认定工伤医疗费农保不能报销。
只要职工遭受事故伤害，属于工伤，无论公司是否申请认定，医疗保险基金不予报销。
社会保险法规定，下列医疗费用不纳入基本医疗保险基金支付范围：
1、应当从工伤保险基金中支付的;
2、应当由第三人负担的;
3、应当由公共卫生负担的;
4、在境外就医的。
医疗费用依法应当由第三人负担，第三人不支付或者无法确定第三人的，由基本医疗保险基金先行支付。基本医疗保险基金先行支付后，有权向第三人追偿。