破坏计算机信息系统罪立案标准：
1、违反国家规定，对计算机信息系统功能进行删除、修改、增加、干扰，造成计算机信息系统不能正常运行，后果严重的。
2、违反国家规定，对计算机信息系统中存储、处理或者传输的数据和应用程序进行删除、修改、增加的操作，后果严重的。
3、故意制作、传播计算机病毒等破坏性程序，影响计算机系统正常运行，后果严重的。