被告人在案件审查起诉阶段的称谓是：犯罪嫌疑人。在公安机关侦查和检察院审查起诉阶段，行为人一般称之为犯罪嫌疑人(根据法律规定，没有经人民法院判决，不得确定任何人有罪)，在法院开庭审理阶段，行为人称之为被告人。在刑事判决书中也会注明是被告人。

对于刑事案件，在刑事侦查阶段和检察院审查起诉阶段，涉嫌犯罪的人称为犯罪嫌疑人的;在检察院向法院起诉时，用在法院审理阶段，涉嫌犯罪的人就称为被告人;在判决生效后，就可称为罪犯或犯罪分子。所以，在检察院的起诉书、及法院的法律文书中，都是将被提起公诉的当事人列为“被告人”的。