有区别。协议书范围比较大，而遗嘱就是遗嘱，是立遗嘱人对个人合法财产进行处理的书面证明。同时，在一定条件下，具有处理遗产内容的合法的协议，也是可以成为遗嘱的。还需要注意的是，遗赠扶养协议，是协议的一种，但其在继承事件中具有的法律效力优先于遗嘱。
《继承法》第五条规定，继承开始后，按照法定继承办理；有遗嘱的，按照遗嘱继承或者遗赠办理；有遗赠扶养协议的，按照协议办理。