1、范围不同

分校：大多是与“本校”在教学管理方面相独立的办学机构。大多是指与“本校”除地理区位不同外其余方面皆保持一致的“本校分部”，在各方面都直接受“本部”领导。

2、生源不同

一般情况下，大学的“校区”没有独立招生的权力，其生源主要依靠校本部统招，再根据专业和年级分配到各个校区，因而生源质量有所保证。与“校区”相比，“分校”大多是与“本校”在教学管理方面相独立的办学机构。

其中一类便是由学校本部与地方政府合作开办的“分校”，例如，北京师范大学珠海分校(原北京师范大学珠海教育园区)即是教育部批准设立、由北京师范大学和珠海市人民政府合作举办、进行本科层次教育的全日制普通高等学校。

3、管理不同

“分校”大多是与“本校”在教学管理方面相独立的办学机构，而“校区”大多是指与“本校”除地理区位不同外其余方面皆保持一致的“本校分部”，在各方面都直接受“本部”领导。这两者前者更强调组织机构关系的“分立”，后者则强调组织关系的统一。

4、规模不同

分校区的建设和教学由校本部统一规划和管理，所开设或者转入的专业多是校本部师资力量较为雄厚的名牌专业，教风、学风也是移植校本部模式。学生在奖贷评优、考研保研、出国就业等方面与校本部享有同等待遇。

在“分校”与“校区”的最大区别中，就不得不提及的就是所颁发的毕业证书，但毕业证书只能作为参考，不能作为唯一的鉴别标准。因为，不管是“分校”还是“校区”毕业生的本科毕业证书由校本部统一颁发，证书的封皮样式和文字与校本部毫无差别，证书内芯同样加盖本部公章和本部校长印。

5、学位不同

大学“分校区”一般没有独立招生的权力，其生源主要依靠校本部统招，再根据专业和年级分配到各个校区，因而生源质量有极好的保证。校区间学生除就学位置、就读专业外，其余待遇皆一致。

6、学校性质不同

分校区：顾名思义，分校区是直属于本校直接管理、负责的校区，也就是说“分校区”和“本校”除了地理位置之外，区别并不大，都是同一所大学，也都由同一个校长管理，其一学校的老师教学；

分校：与分校区不一样，分校虽然挂着“本校”的头衔，但它是独立在“本校”之外的一所学校，不管是学校的教学、管理等都是不同的，在某种意义上也可以说完全是另外一所学校了。

7、教育资源不同

分校区由于直属学校本部统一教学和管理，自然分校区的学生和本部的学生所能享受到的教育资源都是相同的；

而分校由于是独立运营，在这方面相对来说是比不上大学本部的，所以学生们所能享受到的教育资源相对也会差一些。