一、发行条件不同

1、公司债券

证券法第十六条 公开发行公司债券，应当符合下列条件：

（1）股份有限公司的净资产不低于人民币三千万元，有限责任公司的净资产不低于人民币六千万元；

（2）累计债券余额不超过公司净资产的百分之四十；

（3）最近三年平均可分配利润足以支付公司债券一年的利息；

（4）筹集的资金投向符合国家产业政策；

（5）债券的利率不超过国务院限定的利率水平；

（6）国务院规定的其他条件。

2、企业债券

企业债券的主管部门是国家发改委，根据《企业债券管理条例》、发改财经【2004】1134号文和发改财经【2008】7号文的规定，企业债券发行人必须满足如下条件：

（1）筹集资金用途符合国家产业政策和行业发展方向，所需相关手续齐全，包括主管机关批文、土地、环评等；

（2）企业存续时间超过三年，近三年没有重大违法违规行为；

（3）净资产规模达到规定的要求。股份有限公司的净资产不低于人民币3000万元，有限责任公司和其他类型企业的净资产不低于人民币6000万元；

（4）已经发行的企业债券或者其它债务未处于违约或者延迟支付本息的状态；

（5）企业累计发行债券余额不得超过其净资产（不含少数股东权益）40%；

（6）近三年连续盈利，且近三年平均净利润足以支付债券一年的利息，现实审批时国家发改委一般要求近三年平均净利润能够覆盖债券一年利息的1.5倍

二、发行流程不同

1、公司债券

（1）公司董事会制订发行公司债券的方案；

（2）股东大会审议通过公司债券发行方案；

（3）公司向国务院证券管理部门报请批准；

（4）公告公司债券募集办法；

（5）证券经营机构承销发售公司债券；

（6）公众应募、缴款并领取债券；

（7）置备公司债券存根簿。

2、企业债券

（1）董事会和股东会对发行债券作出决议，确定发行主体，选定主承销商；

（2）确定担保人或担保方式，担保通常有第三方担保、土地抵押担保、设立偿债基金等方式；

（3）确定筹集资金的使用项目；

（4）确定其他中介机构，包括会计师事务所、律师事务所、信用评级等中介机构；

（5）确定发行方案；

（6）主承销商协助向地方发改委提出发行企业债券的申请；

（7）主承销商协助企业建立与主管部门的关系；

（8）制作申请材料并报国家发改委审批；

（9）发行和承销准备工作；

（10）发行事宜包括销售、划款、承销工作汇报、验资等；

（11）其他工作包括信息披露、在每个环节作企业的顾问等。

综上所述，在发行上企业债券和公司债券的区别主要是发行条件及其流程的不同。在发行条件上企业债券的资金要求明显高于公司债券，而在流程上也相对的繁琐些。同时他们的审核机构也有所不同，一个是证监会，一个是发改委。如果您还存有其他方面的法律疑惑，可以登入网站寻求专业律师的帮助。