1、时间不同。国都不同。建立者不同。疆域范围不同。西晋的时间靠前，是在265年建立并于316年灭亡，而东晋则是317年建立，420年灭亡。西晋的国都一开始位于洛阳，后因衰败而迁都至长安。

2、东晋的国都则在建康，即为现今的江苏南京地区。西晋是由司马昭之子司马炎建立的，而东晋是由西晋的皇族司马睿南迁建成的，算是延续了晋朝，东晋也称为中晋。西晋领土范围较广。