1、二环系育种：用单交种和一些商品杂交种等作原始材料，一般采取常规的二环系育种方法。

2、群体改良法：利用遗传基础复杂的综合品种或群体作为原始材料选育自交系时，可以采有两种方法：一种是结合群体改良，在进行轮回选择的同时，分离自交系。另一种是按二环系育种方法直接分离自交系。

3、回交改良及定向复交综合法；是改良自交系某些缺点的有效途径。