1、物理清除法：简单的说就是拿刷子去刷，市面上卖的磁铁刷，鱼池刷都很好用，同时并用换水，效果极佳。缺点是麻烦，角落等地方不易清除，而且常常会搞的整缸鸡飞狗跳，缸子一多更是大工程。

2、化学清除法：使用除藻剂，效果普通，优点是对任何藻类都有效，且可有效清除附著在水草、沉木等不易清除地方的藻类。缺点是依据品质不同对鱼和生态平衡有一定程度的冲击。

3、生物清除法〔最佳方式〕：使用除藻动物来控制藻类的数量，效果为三种中所花费时间较长，但最安全也最省力的方式。以下介绍几种常用的除藻生物。