1、区别有以下四点：外观区别，环境区别，经济价值，食用价值。

2、外观区别：花菇和香菇在外观上有一定区别，虽然他们都是蘑菇家族的重要成员，但花菇的个头要比香菇大很多，而且在花菇的菌盖儿上还有大量花纹存在，这些都是香菇所不具有的特点，香菇的外形较小，而且菌盖多是单一的褐色或者灰色。

3、环境区别：花菇和香菇在生长环境上也有明显区别，香菇多喜欢生长在低温少雨，阳光充足，而且温差较大的环境中。而花菇的生活环境则比较苛刻，它是香菇遇到特殊天气以后产生的变异品种，可以说花菇是香菇的一种，而且是香菇的升华品种。

4、经济价值：花菇和香菇在经济价值上也有明显区别，因为花菇只有在特殊气候条件下才会出现，而香菇每年都会有大量出产，所以在市场上，香菇的经济价值远远高于香菇，多数时候花菇的价格都是香菇价格的二倍或者更高。

5、食用价值：花菇和香菇都含有大量的蛋白质和不饱和脂肪酸，还含有多种对人体有益的营养成分，但它们的使用价值也略有不同。花菇中各种营养成分的含量都比较高，而且它们在进入人体后能转化成麦角甾醇，这种物质能增强人体自身的抗病能力，它能预防多种疾病发生，而香菇在这方面的功效相对于花菇就要差很多。