生物发酵是指利用微生物在一定条件下生长代谢的过程中，产生一些有用的代谢产物，如酒精、醋酸、乳酸、氨基酸、酶、抗生素等。其原理主要包括以下几方面：

1. 微生物的代谢特性。微生物有很强的代谢能力，它们能够通过代谢基质物质，产生一些有用的代谢产物，如能源、物质合成前体等。

2. 外部环境条件的调节。外部环境条件对微生物代谢产物的产生有着重要的调节作用，包括温度、pH值、氧气含量、营养物质和微生物密度等。

3. 生物反应的动力学特征。生物反应的动力学特征主要包括发酵物的生长速度、代谢产物的生成速率和产物的稳定性等，这些特性对于发酵过程的设计和控制有着重要的指导意义。

总之，生物发酵原理是利用微生物的生物代谢特性，通过调节外部环境条件和生物反应的动力学特征，产生有用的代谢产物。