常见的发酵饲料消毒方法包括以下几种：

1. 高温消毒：将发酵饲料置于高温环境中，使用蒸汽、高压水蒸气或高温烘箱等方法进行消毒。通常需要在80℃以上持续加热30分钟以上，以杀灭细菌、病毒、真菌等微生物。

2. 紫外线消毒：使用紫外线杀菌灯对发酵饲料进行辐射，以杀灭微生物。紫外线消毒的优点是操作简便，不会对饲料质量造成影响。

3. 化学消毒：使用化学消毒剂对发酵饲料进行处理，以杀灭微生物。常用的化学消毒剂包括过氧化氢、氯气、氯化钠等。需要注意的是，化学消毒剂对饲料中的营养成分和微生物群落也会产生一定影响。

4. 发酵饲料本身的抗菌作用：发酵饲料本身具有一定的抗菌作用，能够抑制细菌和真菌的生长。在发酵过程中逐渐形成的有益菌群能够对细菌和真菌起到抑制作用，从而达到消毒的作用。

需要注意的是，消毒时不能过度，否则可能会破坏饲料中有益的微生物群落，降低饲料营养价值。因此，在选择消毒方法时应根据实际情况选择适当的方法和消毒剂，注意消毒的时间和强度，尽量不影响饲料质量。