1、别称不同：上天竺寺别称为法喜寺。中天竺寺的别称为法净寺。下天竺寺别称为法镜寺。

2、开山祖师不同：上天竺寺开山祖师是僧道翊，其在白云峰下结庐，为上天竺开山祖师。中天竺寺的开山祖师是宝掌禅师。下天竺寺的开山祖师不详。

3、僧侣性别不同：下天竺寺僧侣性别有别于上天竺寺和中天竺寺。下天竺寺僧侣性别是女，上天竺寺和中天竺寺僧侣性别是男。