公鸡打鸣是光刺激的一种本能反应，是由内在的生物钟，激素控制的，但外在的光线和声音刺激也会诱发公鸡打鸣，外在刺激对公鸡打鸣的影响也受公鸡内在控制。鸡的大脑里有个“松果体”可以分泌褪黑素，褪黑素水平下降鸡就会叫。一般情况下，夜里鸡都在睡觉。只有伸手不见五指，松果体才会分泌褪黑素，如果有光射入眼睛，晨光乍现，褪黑素的分泌受到抑制，公鸡就会打鸣了。

有的母鸡也打鸣，或者给母鸡注射雄激素，母鸡也会开始打鸣。这是由于母鸡体内只有左侧的卵巢输卵管发育，右侧的保持着未分化的状态。如果它左侧的卵巢发生了故障，右侧那个未分化的卵巢就会发育成睾丸，并且产生雄激素。在雄激素的催促下，母鸡也就象公鸡一样可以打鸣了。

三更灯火五更鸡，古代的五更就是现在的凌晨三点到五点之间，所以鸡叫第一遍的时间是早上三点左右，预示着天即将蒙蒙亮，太阳很快就会升起，每当鸡叫的时候，人们都要准备起床，或是准备农活或是收拾做饭做菜，总之，这是古人们的天然生物闹钟。